中華穿山甲棲息在亞熱帶地區和熱帶地區的山區森林、灌叢及低度開墾的環境。​

棲息於山麓至海拔 1,000m 左右之山區，但以海拔 300～500m 左右之闊葉林或次生林較常見。2000 m 左右應是穿山甲的分布海拔上限。